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CGBVSによる化合物高速スクリーニングシステムCzeekS - for Virtual Screening -

独自手法CGBVSによる自社データの活用が可能

Chemical Genomics-Based Virtual Screening (CGBVS)では、 タンパク質(Biological space)と化合物(Chemical space)との相互作用情報(ケミカルゲノミクス情報)から抽出された結合パターンより活性化合物を予測します。
CzeekSを導入する事により、製薬企業や研究機関において、自社内に蓄積された独自アッセイデータを用いて、医薬品候補化合物の高速かつ高精度なスクリーニングが可能となります。

●相互作用マシンラーニング法(CGBVS)によるスクリーニング計算を実行
独自計算手法CGBVS をコマンドラインで実行するためのシステムを提供します。高い予測精度で高速なインシリコ化合物スクリーニングを実現します。
●マルチターゲット予測による化合物スクリーニングが可能
複数の標的タンパク質に対するスコアリングにより、化合物の選択性を考慮したスクリーニングが可能です。
●化合物のターゲット探索が可能
化合物毎に予測モデルに含まれる全タンパク質のスコア計算を実行でき、標的タンパク質の探索に応用できます。
●様々な予測モデルをラインナップ
標準予測モデルとして6種類のたんぱく質グループ(GPCR, Kinase, Ion channel, Transporter, Nuclear receptor, Protease)をそろえています。
●独自データを追加して予測モデルの作成が可能
自社内の独自アッセイデータを追加して予測モデルをリファインすることが出来ます。データ追加により学習モデルの予測精度の向上が見込めます。
●マルチコア対応(OpenMP 並列化)
CzeekS をマルチコアCPU の計算機上で利用することにより、CGBVS 計算をより高速で実行できます。

技術基盤

CGBVS(Chemical Genomics Based Virtual Screening )は、京都大学薬学研究科システム創薬科学 奥野恭史教授により開発された高速かつ高い予測精度を誇る計算手法であり、コンステラが京都大学より技術特許の独占実施権を付与されて実施するものです。

CzeekSサンプルムービー

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システムライセンス価格表

node 数 1年間ライセンス価格(税抜) 3年間ライセンス価格(税抜)
1 node ¥500,000 ¥1,350,000
5 node ¥750,000 ¥2,100,000
10 node ¥950,000 ¥2,700,000
無制限 ¥1,900,000 ¥5,500,000

予測モデル

最新のStandardとChEMBL予測モデルは、化合物記述子としてDragon7.06*1を、タンパク記述子としてPROFEAT 2016*2を使用しています。

*1 https://chm.kode-solutions.net/products_dragon.php

*2 http://bidd2.nus.edu.sg/cgi-bin/profeat2016/main.cgi

Standardモデル価格表(ver. 3)New

モデル名 標的
タンパク質数
学習
データ
(相互
作用数)
モデル内容 (標的タンパク質の種類) 価格
(¥;税抜)
GPCR 244 339,239 ClassAα, ClassAβ, ClassAδ, ClassAγ, ClassB, ClassC 500,000
Kinase 412 200,201 AGC, CAMK, CMGC, STE, TK, TKL, others 500,000
Ion channel 218 145,929 Voltage-gated, Ligand-gated, others 500,000
Transporter 151 73,699 Electrochemical, ATPase, ATP-binding casette, others 400,000
Nuclear
receptor
41 130,042 NR1, NR2, NR3, NR4, NR5 400,000
Protease 235 154,243 Endopeptidase, Exopeptidase 500,000

(その他、ご要望に応じてカスタマイズしたモデルを作成いたします。詳細はお問合せください。)

ChEMBL22モデル New

モデル名 標的
タンパク質数
学習
データ
(相互
作用数)
モデル内容 (標的タンパク質の種類)   価格  
GPCR 215 141,360 ClassAα, ClassAβ, ClassAδ, ClassAγ, ClassB, ClassC 無料
Kinase 404 139,338 AGC, CAMK, CMGC, STE, TK, TKL, others 無料
Ion channel 146 43,317 Voltage-gated, Ligand-gated, others 無料
Transporter 87 20,083 Electrochemical, ATPase, ATP-binding casette, others 無料
Nuclear
receptor
40 27,365 NR1, NR2, NR3, NR4, NR5 無料
Protease 204 86,944 Endopeptidase, Exopeptidase 無料

※ChEMBLモデルはChEMBLデータベースリリース22のデータを用いて作成されたモデルです。

ターゲットタンパク質

各予測モデルに含まれるタンパク質のリストです。


以下のリンクより、Excelフォーマットの更新情報とタンパクリストがダウンロードできます。

推奨descriptor

株式会社アフィニティサイエンスのDRAGON特別ライセンスをご利用いただけます。

資料ダウンロード

システムライセンスおよび予測モデルの価格等を記載した製品紹介カタログです。

CzeekSシステムを利用して計算を実行するための製品マニュアルです。